应用Graphpad prism软件绘制柱状图-2组数据
软件：Graphpad prism 9
数据：以qpcr的R2-△△Ct值为例（2组，每组10个生物学重复样本）
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C |
T |
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1.00 |
0.45 |
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0.80 |
0.56 |
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0.87 |
0.49 |
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1.01 |
0.64 |
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0.71 |
0.51 |
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0.92 |
0.42 |
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0.78 |
0.30 |
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1.13 |
0.54 |
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1.07 |
0.62 |
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1.10 |
0.65 |
方法：
1. 打开Graphpad prism 9，选择Column
2. 复制qpcr的R2-△△Ct数据，粘贴
3. 找到Graphs（图），点击以上数据对应的名称,就会出现图形了
4. 选择图形，图形有Individual values，Box and violin，Mean/median & error，可以选择自己喜欢的图形，这里选择Individual values中的第二个，如下图；plot选择“mean with SEM”（均数加减标准误），SEM为标准误，与SD关系为SEM=SD/Sqrt(n)，因此SEM会远小于SD，作图会更好看些
5. 接下来是调整图形的颜值，
（1）调整命名，如删除Data1和Xtitle标题，点击Y轴重新命名
（2）通过change版块调整
：更换图表类型；
：调整图形的大小
：选择colors，默认选择蓝色和红色
：改变X轴和Y轴的信息
：改变柱子的外观
我们根据以上方法，按照自己喜欢的风格，得到的图形如下：
6. 统计学分析
（1）确定统计方法
（2）需要确定是否符合正态分布：
点击Analysis，选择Column analyses——选择Normality and Lognormality Tests，即正态性检验
3. 看正态分布检测结果，一般认为，P>0.05时，数据符合正态分布。这里有几个检测，都满足了正态分布，可以考虑用参数检验中的t检验（如果不满足，则选择非参数检验）
备注：结果列表中，当几种检验不一致时，小样本以shaprio-wilk test为准，大样本以kolmogorov-smimov test为准。
4. 点击Analysis，选择Column analyses——选择t tests(and nonparametric tests)即T检验或者非参数检验
Paired:同一个对象处理/给药前后的差异
Unpaid：两组比较，例如对照组vs实验组
5. 查看结果，P值>0.05,故满足方差齐性。(注意，如果不符合方差齐性，需要重新进行T检验，choose test选择Wech’s矫正，再重复一次分析)
6. 显著性分析结果
7. 显著性分析结果作图，prism 9以上的版本，可选择自动增加显著性分析作图Draw-Automatically add painwise comparisons，然后保存图片即可，建议保存矢量图格式，如PDF，也方便后续在AI上编辑。
