常用内参抗体的选择
蛋白质免疫印迹法(Western Blot)是用于检测蛋白相对表达量的一种技术,可通过条带的强弱来评估目的蛋白在胞内的表达情况。但是运用Western Blot技术比较不同条件下目的蛋白的相对表达量,前提条件是等量的细胞上样,这样子比较才有意义。内参顾名思义就是内部参照(Internal Control)。它们胞内的表达量相对稳定,所以在检测蛋白的表达水平变化时常用来做参照物,在Western Blot中加入内参,就是在进行Western Blot实验时,另外运用内参抗体对内参抗原蛋白进行检测,借助内参的量就可以用于校正上样误差,这样定量的结果才更可信。
常用的蛋白质内参有GAPDH和细胞骨架蛋白beta-actin 或beta-tubulin 。最近的国外文献报道中使用GAPDH内参的较多。
在实验过程中,我们应该怎么选择合适的内参抗体呢?我们可以根据以下方法进行选择。
1. 考虑样本来源
(1)哺乳动物来源的样本,通常可以选择GAPDH、β-actin、β-Tubulin、Histone H3等都是可以的;
(2)如果是植物来源的样本,需要选择植物内参,比如Plant actin;
(3)如果是其他来源的样本,可以参考文献进行选择。
(4)另外,细胞内不同组成的蛋白,选择的内参抗体也是不同的,例如核蛋白可以选用Lamin B1内参。以下是几种常用抗体的分子量及其定位情况:
内参名称 |
分子量大小(KDa) |
定位 |
GAPDH |
36KDa |
胞浆和全细胞 |
β-actin |
42KDa |
胞浆和全细胞 |
β-Tubulin |
50KDa |
胞浆和全细胞 |
Histone H3 |
16KDa |
细胞核 |
Lamin B1 |
67KDa |
细胞核 |
Plant actin |
42 KDa |
植物内参 |
2. 考虑内参蛋白的表达稳定性
确保选择的内参在样品中高表达。大多数常用的内参蛋白是由保守基因高表达的,这些保守基因是细胞发育及维持细胞活力所必须的(即看家基因)。
此外,还应该选择表达不受实验变量影响的内参。最佳的内参应当不受样本来源(如正常和疾病样本)、实验条件的影响。例如,GAPDH 不适用于氧相关研究,因为缺氧可能上调 GAPDH 的表达。
3. 考虑目的蛋白的分子量大小
在进行Western Blot检测时,当目的蛋白的大小与内参蛋白的大小相近时, WB 结果无法直接观察,不容易区分目的蛋白,很难进行准确数据的分析。建议二者至少相差5KD以上。例如目的蛋白的分子量在40KDa时,不建议选择GAPDH和β-actin,可以选择β-Tubulin。