常用内参抗体的选择

蛋白质免疫印迹法(Western Blot)是用于检测蛋白相对表达量的一种技术,可通过条带的强弱来评估目的蛋白在胞内的表达情况。但是运用Western Blot技术比较不同条件下目的蛋白的相对表达量,前提条件是等量的细胞上样,这样子比较才有意义。内参顾名思义就是内部参照(Internal Control它们胞内的表达相对稳定所以在检测蛋白的表达水平变化时常用来做参照物,在Western Blot中加入内参,就是在进行Western Blot实验时,另外运用内参抗体对内参抗原蛋白进行检测,借助内参的量就可以用于校正上样误差,这样定量的结果才更可信

常用的蛋白质内参有GAPDH和细胞骨架蛋白beta-actin 或beta-tubulin 。最近的国外文献报道中使用GAPDH内参的较多。

 

在实验过程中,我们应该怎么选择合适的内参抗体呢?我们可以根据以下方法进行选择。

 

1. 考虑样本来源

(1)哺乳动物来源的样本,通常可以选择GAPDHβ-actinβ-TubulinHistone H3等都是可以的;

(2)如果是植物来源的样本,需要选择植物内参,比如Plant actin

(3)如果是其他来源的样本,可以参考文献进行选择。

(4)另外,细胞内不同组成的蛋白,选择的内参抗体也是不同的,例如核蛋白可以选用Lamin B1内参。以下是几种常用抗体的分子量及其定位情况:

内参名称

分子量大小(KDa

定位

GAPDH

36KDa

胞浆和全细胞

β-actin

42KDa

胞浆和全细胞

β-Tubulin

50KDa

胞浆和全细胞

Histone H3

16KDa

细胞核

Lamin B1

67KDa

细胞核

Plant actin

42 KDa

植物内参

 

 

 

2. 考虑内参蛋白的表达稳定性

确保选择的内参在样品中高表达。大多数常用的内参蛋白是由保守基因高表达的,这些保守基因是细胞发育及维持细胞活力所必须的(即看家基因)。

此外,还应该选择表达不受实验变量影响的内参。最佳的内参应当不受样本来源(如正常和疾病样本)、实验条件的影响。例如,GAPDH 不适用于氧相关研究,因为缺氧可能上调 GAPDH 的表达。

 

3. 考虑目的蛋白的分子量大小

在进行Western Blot检测时,当目的蛋白的大小与内参蛋白的大小相近时, WB 结果无法直接观察,不容易区分目的蛋白,很难进行准确数据的分析。建议二者至少相差5KD以上。例如目的蛋白的分子量在40KDa时,不建议选择GAPDH和β-actin,可以选择β-Tubulin 

 

 

 

2022年11月3日 23:05
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