ChiP 染色质免疫沉淀

1. 技术简介

染色质免疫沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation assay, CHIP)是目前研究体内 DNA 与蛋白质相互作用的方法。 它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA 复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的DNA小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的 DNA 片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与 DNA 相互作用的信息。CHIP 不仅可以检测体内转录因子因子与 DNA 的动态作用,还可以用来研究组蛋白的共价修饰与基因表达的关系。

 

 

 


 

 

2. 技术原理

ChIP染色质免疫共沉淀线路图

 

 


 

 

 

3. 方法介绍

在保持组蛋白和 DNA 联合的同时,通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体,染色 质被切成很小的片断,并沉淀下来。 IP 是利用抗原蛋白质和抗体的特异性结合。其一般实验过程如下:

1)甲醛处理固定细胞收集细胞

2)对细胞进行裂解,并超声破碎DNA

3)加入目的蛋白的抗体,与靶蛋白-DNA复合物相互结合

4)加入ProteinA,结合抗体-靶蛋白-DNA复合物

5)对沉淀下来的复合物进行清洗,除去一些非特异性结合

6)洗脱,得到富集的靶蛋白-DNA复合物

6)解交联,纯化富集的DNA片断

7)对分离得到的DNA片段进行PCR分析或者测序分析。

 

 


 

 

 

3. 客户提供

(1)目的蛋白基因信息(物种、Genebank登录号或基因序列)

(2)目的蛋白抗体,若无抗体,可提供目的基因的质粒,构建融合标签的目的蛋白质粒;

(3)实验样本及其信息(样本类型、样本量).

 

 


 

 

4. 结果交付

(1)诱饵蛋白的Western blot检测数据;

(2)剩余的实验的样本和ChIP产物;

(3)qPCR结果(或者SEQ鉴定结果);

(4)详细的实验报告(包含实验仪器、耗材和试剂、实验方法、结果分析)

 

 

 

2022年4月7日 17:03
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